Важным направлением деятельности холдинга является океаническое рыболовство. Основными объектами промысла добывающего флота являются минтай, сельдь, кальмар, треска. Кроме того, ежегодно, в период прохождения лососевой путины в акваториях Дальневосточных морей, холдинг выставляет от 2 до 5 судов на приёмку горбуши, кеты, нерки, кижуча, гольца.

На начало 2017 года, в состав океанического флота холдинга входят следующие типы судов:

БАТМ (Большой автономный траулер морозильщик пр. 1288) — 6 шт;

БМРТ (Большой морозильный рыболовный траулер пр. В-408) — 3 шт;

СРТМ (Средний рыболовный траулер морозильщик пр. Р-8830 типа стеркодер) — 5 шт;

РТМК-С пр. 488 типа Моонзунд — 1 шт.

В состав транспортного флота, позволяющего добывающим судам своевременно производить отгрузки готовой рыбопродукции, входят 6 единиц транспортных рефрижераторов различного тоннажа: От 10 тысяч тонн до 1,5 тысяч тонн на судно. Общий объём имеющихся морозильных ёмкостей на указанных судах составляет более 30 тысяч нетто/тонн.

Все промысловые суда имеют документы Российского Морского Регистра судоходства, оснащены современными средствами навигации, связи, поискового оборудования, прошли полную или частичную модернизацию, включающую в себя увеличение энерговооруженности судов, увеличение морозильных ёмкостей, установки самого современного технологического и промыслового оборудования.

Ежегодно, океанический флот холдинга способен выпускать 350 тысяч тонн пищевой и кормовой рыбопродукции, включая продукцию глубокой степени переработки: филе минтая и сельди.

Компания является одним из лидеров среди компаний отрасли по ежегодным объёмам добычи, обладает сбалансированными по видовому и количественному составу квотами на добычу водных биологических ресурсов.

Добыча рыбной продукции – одно из основных направлений в работе холдинга. Изначально ориентированная на социально-значимое прибрежное рыболовство, компания активно развивает маломерный флот. С мая по ноябрь в море ежедневно выходят 22 экипажа на промысел минтая, трески, терпуга, горбуши, кеты… В прибрежной зоне Курильских островов рыбачат небольшие траулеры с командой до 10 человек.

Из неводов, которые рыбаки выставляют на пути миграции и нереста рыбы, добытый улов переливают в щелевые кунгасы и транспортируют на береговые перерабатывающие предприятия. От момента вылова до переработки проходит незначительное время, что позволяет выпускать продукцию высочайшего качества.

Прибрежный маломерный флот компании «Гидрострой» дает возможность сохранения традиционного уклада жизни в прибрежных рыболовецких поселках островов Итуруп и Шикотан.